MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 146288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002678	TGC	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
2	NC_002678	AAT	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13470331
3	NC_002678	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470331
4	NC_002678	TTCCAG	2	12	395	406	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	13470331
5	NC_002678	CGG	2	6	426	431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470331
6	NC_002678	TCACCA	2	12	453	464	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13470331
7	NC_002678	TGC	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
8	NC_002678	TAT	2	6	488	493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13470331
9	NC_002678	CGA	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470331
10	NC_002678	TGA	2	6	609	614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470331
11	NC_002678	TCG	2	6	636	641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470331
12	NC_002678	TGA	2	6	732	737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470331
13	NC_002678	TTCG	2	8	769	776	0 %	50 %	25 %	25 %	13470331
14	NC_002678	CAA	2	6	784	789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470331
15	NC_002678	GAA	2	6	1064	1069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470331
16	NC_002678	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
17	NC_002678	AGCG	2	8	1187	1194	25 %	0 %	50 %	25 %	13470332
18	NC_002678	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470332
19	NC_002678	CAC	2	6	1242	1247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
20	NC_002678	GCG	2	6	1260	1265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
21	NC_002678	GCTT	2	8	1281	1288	0 %	50 %	25 %	25 %	13470332
22	NC_002678	GCG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
23	NC_002678	GCA	2	6	1440	1445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
24	NC_002678	GGC	2	6	1459	1464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
25	NC_002678	CTG	2	6	1489	1494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
26	NC_002678	CTG	2	6	1516	1521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
27	NC_002678	ACC	2	6	1559	1564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
28	NC_002678	GTC	2	6	1585	1590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
29	NC_002678	AAG	2	6	1633	1638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470332
30	NC_002678	GGA	2	6	1674	1679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470332
31	NC_002678	GCGGT	2	10	1682	1691	0 %	20 %	60 %	20 %	13470332
32	NC_002678	CTG	2	6	1702	1707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
33	NC_002678	GAC	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
34	NC_002678	CG	3	6	1721	1726	0 %	0 %	50 %	50 %	13470332
35	NC_002678	CGC	2	6	1821	1826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470332
36	NC_002678	CGA	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
37	NC_002678	ATC	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470332
38	NC_002678	AGC	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
39	NC_002678	GAT	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
40	NC_002678	CAC	2	6	1944	1949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470332
41	NC_002678	GC	3	6	1968	1973	0 %	0 %	50 %	50 %	13470332
42	NC_002678	TGA	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
43	NC_002678	GCG	3	9	2051	2059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
44	NC_002678	GCG	2	6	2070	2075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470332
45	NC_002678	TCAG	2	8	2089	2096	25 %	25 %	25 %	25 %	13470332
46	NC_002678	GTC	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470332
47	NC_002678	GAT	2	6	2106	2111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470332
48	NC_002678	GC	4	8	2114	2121	0 %	0 %	50 %	50 %	13470332
49	NC_002678	CGC	2	6	2139	2144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470332
50	NC_002678	CGA	2	6	2214	2219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470332
51	NC_002678	GC	3	6	2258	2263	0 %	0 %	50 %	50 %	13470333
52	NC_002678	CG	3	6	2355	2360	0 %	0 %	50 %	50 %	13470333
53	NC_002678	AT	3	6	2371	2376	50 %	50 %	0 %	0 %	13470333
54	NC_002678	CTC	2	6	2433	2438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470333
55	NC_002678	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470333
56	NC_002678	CTT	2	6	2490	2495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470333
57	NC_002678	GCCT	2	8	2529	2536	0 %	25 %	25 %	50 %	13470333
58	NC_002678	TTG	2	6	2588	2593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470333
59	NC_002678	GTC	2	6	2595	2600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470333
60	NC_002678	CAC	2	6	2619	2624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470333
61	NC_002678	GCCG	2	8	2631	2638	0 %	0 %	50 %	50 %	13470333
62	NC_002678	GCC	3	9	2658	2666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470333
63	NC_002678	GCG	2	6	2687	2692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470333
64	NC_002678	GCA	2	6	2833	2838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
65	NC_002678	CCA	2	6	2906	2911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470334
66	NC_002678	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
67	NC_002678	GC	3	6	3110	3115	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
68	NC_002678	TCG	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
69	NC_002678	GAC	2	6	3179	3184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
70	NC_002678	GCCG	2	8	3200	3207	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
71	NC_002678	GCT	2	6	3235	3240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
72	NC_002678	GGC	2	6	3295	3300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
73	NC_002678	CGA	2	6	3313	3318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
74	NC_002678	TCG	2	6	3351	3356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
75	NC_002678	GA	3	6	3362	3367	50 %	0 %	50 %	0 %	13470334
76	NC_002678	CATC	2	8	3391	3398	25 %	25 %	0 %	50 %	13470334
77	NC_002678	GC	3	6	3399	3404	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
78	NC_002678	GATC	2	8	3436	3443	25 %	25 %	25 %	25 %	13470334
79	NC_002678	TGC	2	6	3462	3467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
80	NC_002678	CGT	2	6	3511	3516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
81	NC_002678	GCC	2	6	3584	3589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
82	NC_002678	GGC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
83	NC_002678	CGA	2	6	3658	3663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
84	NC_002678	GCC	2	6	3752	3757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
85	NC_002678	CCG	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
86	NC_002678	CG	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
87	NC_002678	TGC	2	6	3801	3806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
88	NC_002678	CCG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
89	NC_002678	ATGTCG	2	12	3813	3824	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13470334
90	NC_002678	GCA	2	6	3843	3848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
91	NC_002678	GCT	3	9	3868	3876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
92	NC_002678	CCGG	2	8	3882	3889	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
93	NC_002678	CGG	2	6	3904	3909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
94	NC_002678	GCG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
95	NC_002678	TGACC	2	10	3967	3976	20 %	20 %	20 %	40 %	13470334
96	NC_002678	TGG	2	6	4074	4079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470334
97	NC_002678	CCG	2	6	4101	4106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
98	NC_002678	CGTT	2	8	4140	4147	0 %	50 %	25 %	25 %	13470334
99	NC_002678	AAGGC	2	10	4149	4158	40 %	0 %	40 %	20 %	13470334
100	NC_002678	GC	3	6	4235	4240	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
101	NC_002678	CGG	2	6	4273	4278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
102	NC_002678	CGT	2	6	4282	4287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
103	NC_002678	GAG	2	6	4352	4357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470334
104	NC_002678	CGGC	2	8	4398	4405	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
105	NC_002678	CCG	2	6	4412	4417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
106	NC_002678	CTC	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470334
107	NC_002678	GGC	2	6	4513	4518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
108	NC_002678	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
109	NC_002678	CCT	2	6	4620	4625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470334
110	NC_002678	GGA	2	6	4666	4671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470334
111	NC_002678	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
112	NC_002678	CGA	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
113	NC_002678	CGC	2	6	4998	5003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470334
114	NC_002678	GCG	2	6	5040	5045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
115	NC_002678	TCGA	2	8	5210	5217	25 %	25 %	25 %	25 %	13470334
116	NC_002678	GCA	2	6	5220	5225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
117	NC_002678	CGG	2	6	5239	5244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
118	NC_002678	GTC	2	6	5248	5253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
119	NC_002678	TCA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470334
120	NC_002678	GAC	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
121	NC_002678	ACA	2	6	5424	5429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
122	NC_002678	AGC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
123	NC_002678	CGGC	2	8	5508	5515	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
124	NC_002678	CCATCA	2	12	5565	5576	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	13470334
125	NC_002678	ACC	2	6	5582	5587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470334
126	NC_002678	CGGC	2	8	5593	5600	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
127	NC_002678	GCTC	2	8	5601	5608	0 %	25 %	25 %	50 %	13470334
128	NC_002678	GGC	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470334
129	NC_002678	CTT	2	6	5743	5748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470334
130	NC_002678	GCCG	2	8	5791	5798	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
131	NC_002678	TGC	2	6	5919	5924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
132	NC_002678	ACG	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470334
133	NC_002678	AAC	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
134	NC_002678	TCG	2	6	6045	6050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470334
135	NC_002678	GC	3	6	6051	6056	0 %	0 %	50 %	50 %	13470334
136	NC_002678	CAA	2	6	6118	6123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470334
137	NC_002678	GGCC	2	8	6206	6213	0 %	0 %	50 %	50 %	13470335
138	NC_002678	GAC	2	6	6251	6256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470335
139	NC_002678	GCG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470335
140	NC_002678	GTC	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470335
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149	NC_002678	GCC	2	6	6581	6586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470335
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159	NC_002678	TCA	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470335
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249	NC_002678	TTCG	2	8	10734	10741	0 %	50 %	25 %	25 %	13470339
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253	NC_002678	CG	3	6	11063	11068	0 %	0 %	50 %	50 %	13470339
254	NC_002678	ACG	2	6	11097	11102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470339
255	NC_002678	TGG	2	6	11161	11166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470339
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258	NC_002678	CGGCT	2	10	11283	11292	0 %	20 %	40 %	40 %	13470339
259	NC_002678	GCC	2	6	11394	11399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470340
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261	NC_002678	GAT	2	6	11544	11549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470340
262	NC_002678	GCG	3	9	11576	11584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470340
263	NC_002678	GC	4	8	11610	11617	0 %	0 %	50 %	50 %	13470340
264	NC_002678	CTG	2	6	11646	11651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470340
265	NC_002678	GCCA	2	8	11653	11660	25 %	0 %	25 %	50 %	13470340
266	NC_002678	GTC	2	6	11667	11672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470340
267	NC_002678	CAC	2	6	11724	11729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470340
268	NC_002678	TTGGCC	2	12	11845	11856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470340
269	NC_002678	GCA	2	6	11984	11989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470340
270	NC_002678	CGCC	2	8	12086	12093	0 %	0 %	25 %	75 %	13470341
271	NC_002678	GAA	2	6	12150	12155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470341
272	NC_002678	TCT	2	6	12176	12181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470341
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274	NC_002678	CGG	2	6	12240	12245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470341
275	NC_002678	GCG	2	6	12329	12334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470341
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281	NC_002678	TTG	2	6	12595	12600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470341
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284	NC_002678	GGC	2	6	12689	12694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470341
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288	NC_002678	GCC	2	6	13054	13059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470342
289	NC_002678	GCCGC	2	10	13085	13094	0 %	0 %	40 %	60 %	13470342
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294	NC_002678	CGG	2	6	13301	13306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470342
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299	NC_002678	GGC	2	6	13486	13491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470342
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301	NC_002678	ATT	2	6	13559	13564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13470342
302	NC_002678	CGG	2	6	13587	13592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470342
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353	NC_002678	AGC	2	6	16257	16262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470343
354	NC_002678	GATGGC	2	12	16421	16432	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	13470343
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381	NC_002678	TGAT	2	8	17679	17686	25 %	50 %	25 %	0 %	13470345
382	NC_002678	GCA	2	6	17688	17693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
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386	NC_002678	CGGCGC	2	12	17869	17880	0 %	0 %	50 %	50 %	13470345
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392	NC_002678	AGG	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470345
393	NC_002678	GAC	2	6	18112	18117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
394	NC_002678	GTG	2	6	18242	18247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470345
395	NC_002678	GC	3	6	18257	18262	0 %	0 %	50 %	50 %	13470345
396	NC_002678	CCA	2	6	18289	18294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470345
397	NC_002678	AGA	2	6	18303	18308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470345
398	NC_002678	GCT	2	6	18334	18339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470345
399	NC_002678	CGA	2	6	18391	18396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
400	NC_002678	CGACCA	2	12	18433	18444	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	13470345
401	NC_002678	GC	3	6	18461	18466	0 %	0 %	50 %	50 %	13470345
402	NC_002678	CGA	2	6	18472	18477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
403	NC_002678	CTG	2	6	18494	18499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470345
404	NC_002678	GAC	2	6	18536	18541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
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406	NC_002678	CGA	2	6	18574	18579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470345
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416	NC_002678	CTATGG	2	12	19039	19050	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	13470346
417	NC_002678	CGA	2	6	19072	19077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470346
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420	NC_002678	GC	3	6	19307	19312	0 %	0 %	50 %	50 %	13470346
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424	NC_002678	GAT	2	6	19495	19500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470346
425	NC_002678	GAG	2	6	19502	19507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470346
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427	NC_002678	CGC	2	6	19563	19568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470346
428	NC_002678	GC	3	6	19681	19686	0 %	0 %	50 %	50 %	13470346
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433	NC_002678	CGA	2	6	20064	20069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470347
434	NC_002678	GAC	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470347
435	NC_002678	ATGGA	2	10	20436	20445	40 %	20 %	40 %	0 %	13470348
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445	NC_002678	CCAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	0 %	75 %	13470349
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452	NC_002678	CGC	3	9	21249	21257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470349
453	NC_002678	CTG	2	6	21259	21264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470349
454	NC_002678	GTT	2	6	21521	21526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470350
455	NC_002678	CGG	2	6	21527	21532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470350
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472	NC_002678	GC	3	6	22095	22100	0 %	0 %	50 %	50 %	13470351
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480	NC_002678	ATC	2	6	22358	22363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470351
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489	NC_002678	TGA	2	6	22602	22607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470351
490	NC_002678	CGG	2	6	22638	22643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470351
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496	NC_002678	GC	3	6	23044	23049	0 %	0 %	50 %	50 %	13470352
497	NC_002678	TGCC	2	8	23050	23057	0 %	25 %	25 %	50 %	13470352
498	NC_002678	ACG	2	6	23061	23066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470352
499	NC_002678	CGG	2	6	23113	23118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352
500	NC_002678	CGG	2	6	23154	23159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470352

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